Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMC1P11047 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms