Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms