Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms