Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PF4P02776 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PF4P02776 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms