Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV3-15P01624 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms