Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3BO95985 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms