Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NPHP4O75161 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHP4O75161 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms