Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms