Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCA5O60264 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms