Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALUO43852 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALUO43852 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALUO43852 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALUO43852 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALUO43852 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms