Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHHO43323 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHHO43323 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHHO43323 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms