Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LRRTM2O43300 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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