Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM6AO15550 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms