Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DXG7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DXG7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DXG7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DXG7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DXG7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DXG7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DXG7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DXG7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DXG7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms