Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USH1CQ9Y6N9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
USH1CQ9Y6N9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USH1CQ9Y6N9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms