Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXBP1Q9Y5B6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.9 ms