Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRKBQ9Y3C4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRKBQ9Y3C4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms