Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LQ9UL33 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms