Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
OPTCQ9UBM4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPTCQ9UBM4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPTCQ9UBM4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms