Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO1AQ9UBC5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYO1AQ9UBC5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYO1AQ9UBC5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYO1AQ9UBC5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms