Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP1Q9NZI2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP1Q9NZI2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms