Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACER3Q9NUN7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms