Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMBRA1Q9C0C7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMBRA1Q9C0C7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMBRA1Q9C0C7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMBRA1Q9C0C7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms