Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM2Q9C040 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM2Q9C040 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms