Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM2Q9BVW6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM2Q9BVW6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms