Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCMBPQ9BTE3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCMBPQ9BTE3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCMBPQ9BTE3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms