Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF4Q9BSR8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms