Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP1Q9BPW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms