Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SORT1Q99523 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORT1Q99523 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms