Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms