Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00477Q96M19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms