Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
L3HYPDHQ96EM0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
L3HYPDHQ96EM0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
L3HYPDHQ96EM0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.3 ms