Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF21BQ96EK2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF21BQ96EK2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF21BQ96EK2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms