Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIPC3Q8TF64 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GIPC3Q8TF64 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms