Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVIPQ8NHG7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.4 ms