Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms