Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF248Q8NDW4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF248Q8NDW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms