Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF3Q8N9W5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF3Q8N9W5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF3Q8N9W5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms