Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A9Q8IVM8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC22A9Q8IVM8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms