Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF550Q7Z398 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF550Q7Z398 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms