Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM43Q6ZSC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBM43Q6ZSC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms