Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM20Q6UY09 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms