Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO3Q6UWJ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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