Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCIMPQ6UWF3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCIMPQ6UWF3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms