Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GKAP1Q5VSY0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GKAP1Q5VSY0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms