Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYI8

RABL3, Rab-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL3Q5HYI8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABL3Q5HYI8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL3Q5HYI8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL3Q5HYI8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL3Q5HYI8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL3Q5HYI8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL3Q5HYI8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RABL3Q5HYI8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RABL3Q5HYI8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABL3Q5HYI8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms