Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFX4Q33E94 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX4Q33E94 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms