Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIDA1Q1XH10 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIDA1Q1XH10 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms