Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIX1Q15475 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX1Q15475 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX1Q15475 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
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