Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 NAPA-218ENST00000598615 379 ntTSL 37.89□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-212ENST00000508315 579 ntTSL 47.26□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-223ENST00000514036 575 ntTSL 47.26□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-217ENST00000511652 470 ntTSL 36.62□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-204ENST00000503222 562 ntTSL 46.07□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-218ENST00000512305 542 ntTSL 46.07□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-227ENST00000515448 522 ntTSL 46.07□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-219ENST00000512625 554 ntTSL 45.41□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-210ENST00000507502 340 ntTSL 34.92□□□□□ -1.624e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.178e-7■■■■■ 39.9
PCBP1Q15365 FAM189B-207ENST00000487649 1499 ntTSL 1 (best)20.06■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 39.9
PCBP1Q15365 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 39.9
PCBP1Q15365 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.624e-10■■■■■ 39.9
PCBP1Q15365 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.544e-10■■■■■ 39.9
PCBP1Q15365 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.544e-10■■■■■ 39.9
PCBP1Q15365 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.464e-10■■■■■ 39.9
PCBP1Q15365 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 522.47■■□□□ 1.194e-10■■■■■ 39.9
PCBP1Q15365 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.594e-10■■■■■ 39.9
PCBP1Q15365 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.319e-7■■■■■ 39.9
PCBP1Q15365 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.351e-18■■■■■ 39.8
PCBP1Q15365 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-18■■■■■ 39.8
PCBP1Q15365 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 513.67□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 39.8
PCBP1Q15365 PPP2R1A-202ENST00000391791 979 ntTSL 219.37■□□□□ 0.696e-16■■■■■ 39.7
PCBP1Q15365 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.126e-16■■■■■ 39.7
PCBP1Q15365 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.56e-16■■■■■ 39.7
PCBP1Q15365 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.582e-9■■■■■ 39.6
PCBP1Q15365 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.361e-10■■■■■ 39.5
PCBP1Q15365 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-10■■■■■ 39.5
PCBP1Q15365 DCTN2-215ENST00000550201 1527 ntTSL 514.28□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 39.4
PCBP1Q15365 DCTN2-212ENST00000549394 1439 ntTSL 212.86□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 39.4
PCBP1Q15365 DCTN2-201ENST00000434715 1677 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 39.4
PCBP1Q15365 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 211.64□□□□□ -0.551e-11■■■■■ 39.4
PCBP1Q15365 DCTN2-209ENST00000548249 2061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 39.4
PCBP1Q15365 DCTN2-202ENST00000543672 1321 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 39.4
PCBP1Q15365 DCTN2-205ENST00000546758 817 ntTSL 56.73□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 39.4
PCBP1Q15365 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.126e-9■■■■■ 39.4
PCBP1Q15365 LRP10-204ENST00000551466 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.166e-9■■■■■ 39.4
PCBP1Q15365 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 PLEKHB1-220ENST00000545106 813 ntTSL 222.59■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 PLEKHB1-205ENST00000426191 2022 ntTSL 220.14■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 PXN-222ENST00000637624 4132 ntTSL 211.51□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.428e-8■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.48e-8■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.388e-8■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 UCKL1-207ENST00000632800 1530 ntTSL 515.75■□□□□ 0.118e-8■■■■■ 39.3
PCBP1Q15365 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 58.03□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 39.2
PCBP1Q15365 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.312e-10■■■■■ 39.1
PCBP1Q15365 DNM2-212ENST00000588976 536 ntTSL 514.25□□□□□ -0.137e-8■■■■■ 39
PCBP1Q15365 DNM2-207ENST00000586939 551 ntTSL 413.64□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 39
PCBP1Q15365 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.559e-11■■■■■ 39
PCBP1Q15365 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.259e-11■■■■■ 39
PCBP1Q15365 ZNF444-204ENST00000587236 5565 ntTSL 216.33■□□□□ 0.29e-11■■■■■ 39
PCBP1Q15365 FBRS-204ENST00000482749 725 ntTSL 515.25■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 38.9
PCBP1Q15365 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.874e-10■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 224.86■■□□□ 1.574e-10■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 EXOC3L4-206ENST00000560304 657 ntTSL 323.65■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 EXOC3L4-203ENST00000559661 665 ntTSL 519.91■□□□□ 0.784e-10■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 EXOC3L4-204ENST00000559693 813 ntTSL 319.38■□□□□ 0.694e-10■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.983e-17■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.83e-17■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.623e-17■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 NUTF2-208ENST00000587481 2608 nt10.49□□□□□ -0.733e-17■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.579e-7■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.469e-7■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 GTPBP3-216ENST00000598038 2917 ntTSL 516.14■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.026e-9■■■■■ 38.8
PCBP1Q15365 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.52e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RAB6A-206ENST00000540771 699 ntTSL 524.7■■□□□ 1.542e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 522.79■■□□□ 1.243e-10■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)21.29■■□□□ 13e-10■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RGL2-246ENST00000494550 1027 ntTSL 320.36■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 S100A16-205ENST00000474991 640 ntTSL 220.27■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.786e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 LCN12-205ENST00000470501 1804 ntTSL 219.86■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.673e-10■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)19.14■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RAB6A-208ENST00000541795 1812 ntTSL 219.11■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.486e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 PNPO-216ENST00000641856 2619 nt18.01■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RGL2-245ENST00000491168 2316 ntTSL 217.99■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 HNRNPDL-205ENST00000514511 1143 ntTSL 217.91■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 ACAP3-209ENST00000476572 819 ntTSL 517.6■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 LCN12-213ENST00000494713 524 ntTSL 217.54■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 38.6
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